Microbiología

Resumen de actividad

El grupo realiza investigación sobre las causas, la patogenia, el diagnóstico y el tratamiento de las enfermedades infecciosas. Destaca el estudio de infecciones asociadas a implantes y micobacterias, desarrollo de nuevos tratamientos (bacteriófagos, nanopartículas) y técnicas diagnósticas (biología molecular).

Contribuciones a la sociedad

El Dr. Jaime Esteban: Descripción de la técnica de sonicación para el diagnóstico de infecciones asociadas a implantes. Participación en guías y documentos de consenso nacionales e internacionales sobre el manejo de estas infecciones. Protocolos y documentos de consenso nacionales sobre micobacterias y fagoterapia. Participación en el Plan Nacional contra la Tuberculosis.

La Dra. Meritxell García Quintanilla: Participación en el primer protocolo nacional de terapia de fagos y primer proyecto multicéntrico sobre fagoterapia en España.

Colaboraciones

El grupo de Microbiología colabora con diversos grupos nacionales relacionados con enfermedades infecciosas y microbiología clínica a través del consorcio CIBERINFEC, en el que participa en un grupo multicéntrico y multidisciplinar con investigadores del IIS, CENIM-CSIC, Universidad Carlos III, Hospitales La Paz, 12 de octubre, Santa Creu y Sant Pau y Bellvitge. El grupo además pertenece al CIBEREHD. Colabora también con diversos grupos nacionales en infección osteoarticular y en micobacterias a través de los respectivos grupos de trabajo (GEIO y GEIM) de la SEIMC y de la SMMC (grupo de Micobacterias de Madrid), y con la Universidad Complutense de Madrid. El estudio de variabilidad de virus se hace en colaboración con el Centro de Biología Molecular "Severo Ochoa" (CSIC-UAM), el Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC) y el Instituto de Biología Molecular de Barcelona (IBMB) a través de la plataforma PTI Salud Global. También colabora con grupos europeos a través de los grupos de trabajo ESGIAI, ESGB y ESGMYC de la ESCMID, y con colaboraciones puntuales con las Universidades de Helsinki, Aarhus, Gante y Ohio State, así como con diversos centros de referencia internacionales. Las colaboraciones se han establecido sobre la base de la realización de estudios de biomateriales, nuevos tratamientos, infecciones asociadas a implantes, infecciones nosocomiales e infecciones por micobacterias. Respecto a las colaboraciones relacionadas con fagoterapia, destacan grupos nacionales como el Instituto de Investigación Biomédica (INIBIC) - Hospital Universitario de La Coruña, el Centro de Biotecnología y Genómica de Plantas (CBGP) UPM-INIA de Madrid, grupos a través de la red FAGOMA como el Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC), Instituto Cavanilles de Biodiversidad y Biología Evolutiva - Universidad de Valencia, o internacionales como el Hospital de la Croix Rousse de los Hospices Civils de Lyon y el Instituto de Recherche en Infectiologie de Montpellier (IRIm - CNRS).

Tesis doctorales

6.2.3-MICROBIOLOGÍA-TESIS

Relación de publicaciones ordenadas por fecha de publicación

Puzzles, challenges, and information reservoir of SARS-CoV-2 quasispecies.

Domingo E, Martínez-González B, García-Crespo C, Somovilla P, de Ávila AI, Soria ME, Durán-Pastor A, Perales C.

J Virol. 2023 Dec 21.97(12):e0151123.

PMID: 38092661

FI: 5,4

HLA-A*11:01 and HLA-C*04:01 are associated with severe COVID-19.

Castro-Santos P, Rojas-Martinez A, Riancho JA, Lapunzina P, Flores C, Carracedo Á, Díaz-Peña R; Scourge Cohort Group (Llanos L, Almoguera B, Ayuso C, Corton M, Mínguez P, Mahillo-Fernández I, Zazo S, Rojo F, Gadea I, Sarah Heili-Frades,Sanchez-Pernaute O).

HLA. 2023 Dec;102(6):731-739.

PMID: 37528566

FI: 8

Mycobacterium biofilms.

Muñoz-Egea MC, Akir A, Esteban J.

Biofilm. 2023 Dec.5:100107.

PMID: 36798742

FI: 6,8

Multicenter evaluation of BioFire JI panel related to improved microbiological diagnostics on acute osteoarticular infections.

Salar-Vidal L, Chaves C, Dianzo-Delgado IT, Favier P, Giner-Almaraz S, Gómez-Gómez MJ, Martín-Gutiérrez G, Pereira I, Rodríguez-Fernández A, Ruiz-Garbajosa P, Salas-Venero C, Esteban J.

Int J Med Microbiol. 2023 Nov.313(6):151588.

PMID: 37925748

FI: 4,1

Multicenter evaluation of the BIOFIRE Joint Infection Panel for the detection of bacteria, yeast, and AMR genes in synovial fluid samples.

Esteban J, Salar-Vidal L, Schmitt BH, Waggoner A, Laurent F, Abad L, Bauer TW, Mazariegos I, Balada-Llasat J-M, Horn J, Wolk DM, Jefferis A, Hermans M, Verhoofstad I, Butler-Wu SM, Umali-Wilcox M, Murphy C, Cabrera B, Craft D, von Bredow B, Leber A, Everhart K, Dien Bard J, Flores II, Daly J, Barr R, Holmberg K, Graue C, Kensinger B.

J Clin Microbiol. 2023 Nov 21.61(11):e0035723.

PMID: 37877730

FI: 9,4

Fever of unknown origin in a solid organ transplant recipient.

Suárez EU, Soto C, Petkova Saiz E.

Med Clin (Barc). 2023 Oct 31.

PMID: 37919118

FI: 3,9

Study of the antimicrobial activity of cationic carbosilane dendrimers against clinical strains of multidrug-resistant bacteria and their biofilms.

Hernando-Gozalo M, Aguilera-Correa JJ, Rescalvo-Casas C, Seijas-Pereda L, García-Bertolín C, de la Mata FJ, Sánchez-Nieves J, Cuadros J, Pérez-Tanoira R.

Front Cell Infect Microbiol. 2023.13:1203991.

PMID: 37886663

FI: 5,7

Comparison of Extracellular Vesicle Isolation Methods for miRNA Sequencing.

Llorens-Revull M, Martínez-González B, Quer J, Esteban JI, Núñez-Moreno G, Mínguez P, Burgui I, Ramos-Ruíz R, Soria ME, Rico A, Riveiro-Barciela M, Sauleda S, Piron M, Corrales I, Borràs FE, Rodríguez-Frías F, Rando A, Ramírez-Serra C, Camós S, Domingo E, Bes M, Perales C, Costafreda MI.

Int J Mol Sci. 2023 Jul 29.24(15).

PMID: 37569568

FI: 5,6

Is an isolated positive sonication fluid culture in revision arthroplasties clinically relevant?

Rondaan C, Maso A, Birlutiu RM, Fernandez Sampedro M, Soriano A, Diaz de Brito V, Gómez Junyent J, Del Toro MD, Hofstaetter JG, Salles MJ, Esteban J, Wouthuyzen-Bakker M, ESCMID Study Group on Implant Associated Infections (ESGIAI).

Clin Microbiol Infect. 2023 Jul 28.

PMID: 37516385

FI: 14,2

Antibacterial Properties of Mesoporous Silica Nanoparticles Modified with Fluoroquinolones and Copper or Silver Species.

Ugalde-Arbizu M, Aguilera-Correa JJ, San Sebastian E, Páez PL, Nogales E, Esteban J, Gómez-Ruiz S.

Pharmaceuticals (Basel). 2023 Jul 05.16(7).

PMID: 37513873

FI: 4,6

Bacteriophage-Antibiotic Combination Therapy against Pseudomonas aeruginosa.

Santamaría-Corral G, Senhaji-Kacha A, Broncano-Lavado A, Esteban J, García-Quintanilla M.

Antibiotics (Basel). 2023 Jun 22.12(7).

PMID: 37508185

FI: 4,8

Reduction of methicillin-resistant Staphylococcus aureus biofilm growth and development using arctic berry extracts.

Aguilera-Correa JJ, Nohynek L, Alakomi HL, Esteban J, Oksman-Caldentey KM, Puupponen-Pimiä R, Kinnari TJ, Perez-Tanoira R.

Front Cell Infect Microbiol. 2023.13:1176755.

PMID: 37424779

FI: 5,7

Fitness-Dependent, Mild Mutagenic Activity of Sofosbuvir for Hepatitis C Virus.

Martínez-González B, Gallego I, Gregori J, Soria ME, Somovilla P, de Ávila AI, García-Crespo C, Durán-Pastor A, Briones C, Gómez J, Quer J, Domingo E, Perales C.

Antimicrob Agents Chemother. 2023 Jun 27:e0039423.

PMID: 37367486

FI: 4,9

Subspecies Distribution and Antimicrobial Susceptibility Testing of Mycobacterium abscessus Clinical Isolates in Madrid, Spain: a Retrospective Multicenter Study.

Ruedas-López A, Tato M, Broncano-Lavado A, Esteban J, Ruiz-Serrano MJ, Sánchez-Cueto M, Toro C, Domingo D, Cacho J, Barrado L, López-Roa P.

Microbiol Spectr. 2023 Jun 15.11(3):e0504122.

PMID: 37212700

FI: 3,7

Positron Emission Tomography-Computed Tomography and Magnetic Resonance Imaging Assessments in a Mouse Model of Implant-Related Bone and Joint Staphylococcus aureus Infection.

Aguilera-Correa JJ, Salinas B, González-Arjona M, de Pablo D, Muñoz P, Bouza E, Fernández Aceñero MJ, Esteban J, Desco M, Cussó L.

Microbiol Spectr. 2023 Jun 15.11(3):e0454022.

PMID: 37010409

FI: 3,7

Periprosthetic joint infection caused by Haemophilus parainfluenzae. Case report and literature review.

Medel-Plaza M, Auñón A, Blanco A, García-Cañete J, Salar-Vidal L, Esteban J.

Rev Esp Quimioter. 2023 Jun.36(3):325-328.

PMID: 36924032

FI: 1,9

Randomized Clinical Trial of the Need for Antibiotic Treatment for Low-Risk Catheter-Related Bloodstream Infection Caused by Coagulase-Negative Staphylococci.

Badia-Cebada L, Carmezim J, Pérez-Rodríguez MT, Bereciartua E, López LE, Montenegro MR, Pomar V, Andrés M, Petkova E, Sopena N, Lora-Tamayo J, Monsálvez V, Ramirez-Hidalgo MF, Gómez-Zorrilla S, Boix L, Meije Y, Jiménez E, Gasch O.

Antibiotics (Basel). 2023 May 01.12(5).

PMID: 37237744

FI: 4,8

Differences in Virulence Factors and Antimicrobial Susceptibility of Uropathogenic Enterococcus spp. Strains in a Rural Area of Uganda and a Spanish Secondary Hospital.

Carrasco Calzada F, Jairo Aguilera J, Moreno JE, Cuadros González J, Roca Biosca D, Prieto-Pérez L, Pérez-Tanoira R.

Trop Med Infect Dis. 2023 May 16.8(5).

PMID: 37235330

FI: 2,9

GWAS and meta-analysis identifies 49 genetic variants underlying critical COVID-19.

Pairo-Castineira E, Rawlik K, Bretherick AD, Qi T, Wu Y, Nassiri I, McConkey GA, Zechner M, Klaric L, Griffiths F, Oosthuyzen W, Kousathanas A, Richmond A, Millar J, Russell CD, Malinauskas T, Thwaites R, Morrice K, Keating S, Maslove D, Nichol A, Semple MG, Knight J, Shankar-Hari M, Summers C, Hinds C, Horby P, Ling L, McAuley D, Montgomery H, Openshaw PJM, Begg C, Walsh T, Tenesa A, Flores C, Riancho JA, Rojas-Martinez A, Lapunzina P; GenOMICC Investigators; SCOURGE Consortium; ISARICC Investigators; 23andMe COVID-19 Team; Yang J, Ponting CP, Wilson JF, Vitart V, Abedalthagafi M, Luchessi AD, Parra EJ, Cruz R, Carracedo A, Fawkes A, Murphy L, Rowan K, Pereira AC, Law A, Fairfax B, Hendry SC, Baillie JK. (Llanos L, Ayuso C, Gadea I, Sarah Heili-Frades, Sanchez-Pernaute O).

Nature. 2023 May;617(7962):764-768.

PMID: 37198478

FI: 64,8

Current treatment options for Mycobacterium marinum cutaneous infections.

Medel-Plaza M, Esteban J.

Expert Opin Pharmacother. 2023.24(10):1113-1123.

PMID: 37145964

FI: 3,2

Enterobacter cloacae Infection After Surgical Treatment of Ankle Fractures, a Multicenter Observational Study.

García Cardona C, Bernaus Johnson MC, Martínez Ros J, Hernández-Gonzalez N, Auñon Rubio Á, Anglès Crespo F, Arteagoitia-Colino I, Coifman-Lucena I, Esteban-Moreno J, Moral Escudero E, Gómez García L, Nóvoa Martínez R, Ortega Columbrans A, Veloso Duran M, Font-Vizcarra L.

Foot Ankle Int. 2023 May.44(5):424-430.

PMID: 36923994

FI: 2,7

In vivo effect of mouthwashes on viable viral load of SARS-CoV-2 in saliva: a pilot study.

Sánchez Barrueco A, Mateos-Moreno MV, Villacampa Aubá JM, Campos González A, Bogoya Castaño A, Rubio Yanguas R, Blanco Goñi A, Zapardiel Ferrero J, Cenjor Español C, Ausina Márquez V, García-Esteban S, Artacho A, López Labrador FX, Mira A, Ferrer MD.

J Oral Microbiol. 2023.15(1):2198432.

PMID: 37063978

FI: 4,5

Clinical Evaluation of Nontuberculous Mycobacteria (NTM) Elite Agar, a New Medium for the Isolation of NTM: a Multicenter Study.

Broncano-Lavado A, Barrado L, Lopez-Roa P, Cacho J, Domingo D, Hernandez S, Garcia-Martinez J, Millan MR, Perez-Cecilia E, Ruiz-Serrano MJ, Salso S, Simon M, Tato M, Toro C, Valverde-Canovas JF, Esteban J.

J Clin Microbiol. 2023 Apr 20.61(4):e0003623.

PMID: 36975783

FI: 9,4

Molecular Diagnosis of Osteoarticular Implant-Associated Infection: Available Techniques and How We Can Use Them.

Salar-Vidal, L; Auñón, A; Esteban, J.

PROSTHESIS. 2023. MAR. 5 (1): 1-12.

PMID: 10.3390/prosthesis5010001

FI: 3,4

Invasive Cutaneous Candidiasis, Autoimmune Hemolytic Anemia and Pancytopenia: A Challenging Scenario for Waldenström Macroglobulinemia in an Elderly Patient.

Caballero JC, Askari E, Carrasco N, Piris MA, Perez de Camino B, Pardo L, Cornago J, Lopez-Lorenzo JL, Llamas P, Solan L.

Biomedicines. 2023 Mar 24.11(4).

PMID: 37189625

FI: 4,7

Synthesis, characterization, and antibacterial activities of a heteroscorpionate derivative platinum complex against methicillin-resistant Staphylococcus aureus.

Nam-Cha SH, Domínguez-Jurado E, Tinoco-Valencia SL, Pérez-Tanoira R, Morata-Moreno N, Alfaro-Ruiza R, Lara-Sánchez A, Esteban J, Luján R, Alonso-Moreno C, Seguí P, Ocaña A, Gónzalez ÁL, Aguilera-Correa JJ, Pérez-Martínez FC, Alarcón MM.

Front Cell Infect Microbiol. 2023.13:1100947.

PMID: 37051297

FI: 5,7

Hepatitis C virus fitness can influence the extent of infection-mediated epigenetic modifications in the host cells.

García-Crespo C, Francisco-Recuero I, Gallego I, Camblor-Murube M, Soria ME, López-López A, de Ávila AI, Madejón A, García-Samaniego J, Domingo E, Sánchez-Pacheco A, Perales C.

Front Cell Infect Microbiol. 2023.13:1057082.

PMID: 36992689

FI: 5,7

The Antimicrobial Activity of Micron-Thin Sol-Gel Films Loaded with Linezolid and Cefoxitin for Local Prevention of Orthopedic Prosthesis-Related Infections.

Toirac B, Aguilera-Correa JJ, Mediero A, Esteban J, Jiménez-Morales A.

Gels. 2023 Feb 23.9(3).

PMID: 36975625

FI: 4,6

Dual Anticancer and Antibacterial Properties of Silica-Based Theranostic Nanomaterials Functionalized with Coumarin343, Folic Acid and a Cytotoxic Organotin (IV) Metallodrug.

Ugalde-Arbizu M, Aguilera-Correa JJ, García-Almodóvar V, Ovejero-Paredes K, Díaz-García D, Esteban J, Páez PL, Prashar S, San Sebastian E, Filice M, Gómez-Ruiz S.

Pharmaceutics. 2023 Feb 07.15(2).

PMID: 36839883

FI: 5,4

Differences in In Vitro Bacterial Adherence between Ti6Al4V and CoCrMo Alloys.

Martín-García M, Aguilera-Correa JJ, Arenas MÁ, García-Diego IM, Conde A, de Damborenea JJ, Esteban J.

Materials (Basel). 2023 Feb 10.16(4).

PMID: 36837133

FI: 3,4

Rare Recombinant GI.5[P4] Norovirus That Caused a Large Foodborne Outbreak of Gastroenteritis in a Hotel in Spain in 2021.

Alarcón-Linares ME, Moreno-Docón A, Pérez-Serna L, Camacho J, Rodriguez DS, Gutiérrez-Martín ML, Broncano-Lavado A, Echevarria JE, Cabrerizo M, Fernández-García MD.

Microbiol Spectr. 2023 Feb 21.11(2):e0485722.

PMID: 36809021

FI: 3,7

Atypical Mutational Spectrum of SARS-CoV-2 Replicating in the Presence of Ribavirin.

Somovilla P, García-Crespo C, Martínez-González B, Soria ME, de Ávila AI, Gallego I, Mínguez P, Durán-Pastor A, Ferrer-Orta C, Salar-Vidal L, Esteban-Muñoz M, Zuñiga S, Sola I, Enjuanes L, Esteban J, Fernandez-Roblas R, Gadea I, Gómez J, Verdaguer N, Domingo E, Perales C.

Antimicrob Agents Chemother. 2023 Jan 24.67(1):e0131522.

PMID: 36602354

FI: 4,9

Viral Fitness, Population Complexity, Host Interactions, and Resistance to Antiviral Agents.

Domingo E, García-Crespo C, Soria ME, Perales C.

Curr Top Microbiol Immunol. 2023.439:197-235.

PMID: 36592247

FI: 0

Sustained hyperkalemia in an asymptomatic primary care patient. When to suspect familial pseudohyperkalemia.

Castillo Pérez C, Rodríguez Alonso L, Prados Boluda A, Cebrián Ballesteros M, Torrubia Dodero B.

Adv Lab Med. 2022 Oct.3(3):303-312.

PMID: 37362145

FI: 1